Po vyčistení a dezinfekcii pred použitím, či je Petriho miska čistá alebo nie, má veľký vplyv na prácu, čo môže ovplyvniť pH kultivačného média. Ak existujú nejaké chemikálie, inhibuje rast baktérií.
Novo zakúpený Petriho riad by sa mal najprv umyť horúcou vodou, potom namočiť do roztoku kyseliny chlorovodíkovej s hmotnostnou frakciou 1% alebo 2% na niekoľko hodín, aby sa odstránili voľné alkalické látky, a potom sa dvakrát umyť destilovanou vodou.
Ak chcete pestovať baktérie, potom použite vysokotlakovú paru (všeobecne 6,8 * 10 výkon PA vysokotlakovej pary), sterilizujte pri teplote 120 °C po dobu 30 minút, sušte pri izbovej teplote alebo sterilizujte suchým teplom, to znamená, že vložte kultivačný pokrm do rúry a uchovávajte ho pri teplote asi 120 °C po dobu 2h, aby ste zabili bunkové zuby baktérií.
Iba sterilizované Petriho misky môžu byť naočkované a kultivované.